Bonsoir @paloir
J'ai pu me renseigner sur le sujet auprès de @jasonblais.
En gros, Mattermost ne supporte pas l'intégration par le biais d'iframe, mais reste ouvert à toutes propositions de code ou de push requests sur Github, si tu as le temps d'implémenter la fonctionnalité 
En fait, d'après jason, cette question a déjà été posée et n'a pas eu de consensus car ça posait des questions de sécurité: https://github.com/mattermost/platform/issues/4607#issuecomment-262090872
En gros, ce lien dit que Mattermost ne supporte pas les iframe d'un autre site à moins qu'elle provienne de la même origine. L'utilisateur final peut utiliser le "Javascript driver" pour coder cette fonctionnalité.